#parasits

[morethanus-life]

Behaviour category – winner. 

Your Home and My Home by Qing Lin (Canada).

Clownfish must be among the most photographed of all sea creatures. But looking closer, Lin noticed parasitic isopods in the mouths of these little fish. The judge appreciated the whole scene: “Six eyes all in pin-sharp focus, looking into the lens of the author ... this was one of my favourite shots of the entire competition.”

Photograph: Qing Lin/UPY2017

[pxssagat]

our bodies are built for contamination and we don’t have actual borders; we’re continually invaded and infiltrated in both benign and negative ways. So we are both the host and the invader, and the idea of a simple binary like that becomes more ludicrous the more you think about it.

Jeff VanderMeer

[monmicroscopic-blog]

Descobertes noves espècies de cucs menja ossos a l'Antàrtic

Fins fa poc, només s'havien descrit cinc espècies del gènere Osedax, però fa uns mesos, investigadors van descobrir dues noves espècies. El nom d'aquest gènere prové del llatí i vol dir menjador d'ossos. 

Aquests anèlids que viuen als cossos de balena en descomposició, no tenen aparell digestiu i necessiten bacteris simbionts per poder alimentar-se. 

Imatge Osedax rubiplumus | Robert C. Vrijenhoek, Shannon B. Johnson & Greg W. Rouse

Més informació | Bone-eating worms from the Antarctic: the contrasting fate of whale and wood remains on the Southern Ocean seafloor

[monmicroscopic-blog]

Cicle de Plasmodium

[monmicroscopic-blog]

[monmicroscopic-blog]

[monmicroscopic-blog]

Extracció de DNA

Avui he decidit que us explicaré una tècnica molt utilitzada en parasitologia i en molts altres àmbits de la biologia. Es tracta de l'extracció de DNA.

Protocol extracció de DNA

Aquesta tècnica l'estic fent molt últimament i m'agradaria explicar-vos el protocol que segueixo.

Per fer l'extracció utilitzo un kit de Roche i el primer que faig és posar el termoblock a 70ºC. Un cop he encès el termoblock descongelo les mostres de les que vull extreure el DNA i la proteinasa K que està aliquotada al congelador. La proteinasa K serveix per inactivar i lisar les DNases endògenes que ens podrien degradar el DNA.

Mentre que es decongelen les mostres i la proteinasa K i va pujant la temperatura del termoblock aliquoto la quantitat que necessitaré d'Elution Buffer (200µl per mostra). Aquesta alíquota d'Elution Buffer la posaré al termoblock fins l'últim pas de l'extracció que és quan la necessitaré.

Un cop està tot descongelat poso en un eppendorf 200µl de mostra, 200µl de Binding Buffer i 40 µl de Proteinasa K. Fem vòrtex (molt important perquè sino no surt bé l'extracció) i el posem 30-45 minuts a 70ºC al termoblock.

Mentre esperem que passi aquest temps podem anar rotulant les columnes amb filtre que farem servir a continuació.

Un cop passat el temps d'incubació afegim 100µl d'Isopropanol, fem vòrtex.

Passem tot el contingut de l'eppendorf a la columna amb filtre que prèviament havíem rotulat. Centrifuguem 1 minut a 8.000g.

Descartem el contingut que ha quedat al tub col·lector i el tub col·lector. Posem un nou tub col·lector i afegim 500µl d'Inhibitor Removal Buffer.

Tornem a centrifugar 1 minut a 8.000g.

Descartem el contingut que ha quedat al tub col·lector i el tub col·lector. Posem un nou tub col·lector i afegim 450µl de Wash Buffer. Centrifuguem 1 minut a 8.000g.

Descartem el contingut que ha quedat al tub col·lector i el tub col·lector i repetim el pas anterior.

Ara només cal que descartem el contingut que ha quedat al tub col·lector i centrifuguem 10 segons a 13.000g. 

Descartem per última vegada el tub col·lector i afegim 200µl de l'Elution Buffer que tenim al termoblock a 70ºC. 

Centrifuguem 1 minut a 8.000g.

Rotulem uns tubs eppendorfs, seran els definitius, on posarem el DNA extret de la nostra mostra. I ara ens quedem amb el tub col·lector i el seu contingut i llencem el filtre.

Per acabar passem tot aquest contingut al eppendrof i ja podem fer la PCR o emmagatzemar-lo a -40ºC per fer un altre dia l'amplificació.