🗓 Un día como hoy pero de 1998, Carlos Bianchi debutó como DT de Boca en un amistoso ante Rosario Central.
🏆 Así comenzaba el ciclo más exitoso en la historia del club, en el que tocó su punto más alto consiguiendo el máximo título a nivel mundial frente al Real Madrid.
➡️En 1998 asumió la dirección técnica de Boca Juniors y hasta el fin de su contrato en 2001 obtuvo varios torneos: Ganó tres Ligas, dos Copas Libertadores (tras 22 años sin ganarla por Boca) y una Copa Intercontinental, derrotando a Real Madrid el 28 de noviembre del 2000. Ganó el Torneo Apertura 1998 y el Torneo Clausura 1999, siendo bicampeón, y con un récord de 40 partidos invicto.
En 2001 y luego de perder la intercontinental frente a Bayern Munich, finaliza su contrato como entrenador.
Su vuelta a Boca iba a ser en la temporada 2003-2004. En ese período ganó una Liga, una Copa Libertadores y la Copa Intercontinental 2003, imponiéndose al AC Milan. En 2004 luego de perder la final de la Copa Libertadores con Once Caldas renuncia a su cargo.
Su tercer ciclo como DT: Cada vez que un DT era echado, dimitía o finalizaba su contrato, el Virrey aparecía en carpeta, pero por razones desconocidas rechazó varias veces el puesto, finalmente, luego de varias reuniones, aceptaría la oferta de Club Atlético Boca Juniors que lo ligará al club por 3 años, comenzando, el día 5 de enero de 2013, su tercer ciclo en la institución.
El primer partido oficial, que también marcaba su regreso a La Bombonera, fué el 9 de febrero de 2013 con un triunfo de Boca por 3 - 2 sobre Quilmes, dando vuelta un resultado que comenzó siendo adverso. Luego no sumaría de a 3 puntos por los siguientes 12 partidos, y terminaría ante-ultimo a 1 punto de Unión el torneo final. A pesar del mal andar en el Torneo Final 2013, el club xeneize lograría ubicarse entre los 8 mejores equipos del continente, al alcanzar los cuartos de final de la Copa Libertadores al vencer en el duelo de los Octavos de Final al Corinthians brasileño por un marcador de 1 a 0 y lograr un valioso empate en la vuelta, en condición de visitante. Pese a eliminar al candidato más fuerte que tenía la competición en aquel momento, el equipo de la ribera no podría avanzar a Semifinales ya que caería contra Newell's Old Boys en la tanda de penales tras los resultados de ida y vuelta que terminaron 0-0.
Pese a haber sido un semestre sin títulos, Carlos Bianchi continuó en su cargo contando con el unánime apoyo popular del público Xeneize, comenzando así un semestre donde tendría una sola competencia, el Torneo Inicial 2013, sus dirigidos no serían campeones y acabarían el torneo en la posición 7°, cerrando así la primera mitad de la temporada y preparándose para afrontar un nuevo torneo corto, el Torneo Final 2014.
En el Torneo Final 2014 finaliza en la 2° posición, ubicándose debajo de River Plate. Debido a la buena campaña obtiene un boleto para la próxima Copa Sudamericana 2014, y finaliza en segundo en la tabla general del Campeonato de Primera División 2013/14.
El 28 de agosto de 2014, luego de 3 derrotas y una victoria , fue despedido por decisión unánime de la Comisión Directiva del club; Hecho que dejó en desconformidad a los aficionados Xeneizes porque -a pesar de no haber alcanzado las expectativas en su tercer ciclo- se entendió como un mal trato por parte de la dirigencia comandada por el presidente Daniel Angelici para con el Director Técnico más ganador del Club de La Boca y reconocido por los hinchas.