Another meet-up, another round of feedback!
Between 26-28th September, the Aalto-Helsinki team was represented by team member Zsofia at its third meet-up of the year - the JuniorJam, held in Münster, Germany.
The event was full of exciting workshops, valuable practice sessions, and great fun socialising with other teams across Europe. It was attended by 14 teams across 7 different countries, including Germany, the Netherlands, the UK, Austria, Switzerland, Belgium, and of course, Finland.
The main purpose of the JuniorJam was to present/rehearse and, as a result, obtain feedback on 3 key elements of our iGEM projects (listed below). Three judges, who were either former iGEM participants or members of the German Association for Synthetic Biology (GASB), were tasked with giving this feedback.
The main presentation, as done in front of judges at the Grand Jamboree. Zsofia gave a 15-minute presentation on the second day of the meet-up to an audience of 80 people, going through the main motivations of our solution, the problem we are solving, and the dry- and wet-lab methodology we are using to do so. We received some key comments on this presentation to improve by our Paris judging session, including the clearing up of certain difficult scientific concepts (exact mechanism of DARPin library selection and putting together of bioreporter parts) and forming a more fluid, organic storyline instead of splitting up the presentation into several separate sections.
The promotion video, which we have since completed and submitted on 2nd September. Our video was generally very well-received, with a particular strength being the inclusion of clinical staff to explain the chronic wound challenge in hospitals. We still needed to add some captions to make the video more comprehensible and to include some additional animations on how biofilms form and how DARPins bind to AIPs.
The poster and booth, which will be set up at the final venue in Paris. We received some useful comments about reordering some of the text on our poster to introduce what DARPins are earlier on, as well as to improve the colour scheme to make it pop a bit more from the darker shades. In general, Zsofia was able to have some nice discussions with other teams about the Q-block project, as several iGEMers came up to our booth to ask deeper questions about the utility of DARPins and how they could be used in the clinic. This shed further light on what we might need to think of for the judging Q&A session.
Our main collaborator, the Dresden team, was also present. Unfortunately, due to an error in the sequence of our Dresden DARPin, Zsofia could not transport the freeze-dried GFP targeting DARPin to the meet-up as originally planned. However, we have since reordered the GFP targeting DARPin sequence for Dresden and are currently expressing, purifying and freeze-drying the GFP targeting DARPin for them. We already successfully transformed the plasmid that encodes the GFP targeting DARPin into α5 E. coli and hope to retrieve it soon to send the freeze-dried DARPin to the Dresden Team. They plan to assess how a DARPin passes through their hydrogel via an ELISA.
A bit about the other activities. There were three particularly inspiring scientific talks and panel sessions, including "Regulation of angiogenesis by the extracellular matrix – a biomaterials approach" by Britta Trappmann, from the Max-Planck-Institute of Münster; a presentation on the harvesting sustainable rubber from Russian dandelion by Prof. Dr. Prüfer, University of Münster; and a panel discussion between lawyers, bioethicists and scientists about the role of synthetic biology in forming a sustainable bioeconomy.
Zsofia also attended a 1-hour start-up workshop, which encouraged thinking about our project idea in an entrepreneurial way. This involved designing a so-called ‘lean canvas’, on which the target market, manufacturing process, costing and design are ideated. This session was very interactive and useful for thinking of our solution as an idea with concrete potential for the wound care market, not just a finite research project for the sake of a competition. The road doesn’t need to end with the iGEM judging session!
Finally, the Münster team organised some wonderful social time for all attendees, such as an evening by the Aasee, a Syrian food-truck for lunch, an evening at Bar Barzillus, and a breakfast on the final morning. We are very grateful to Münster for this opportunity, and can’t wait to see all the other teams again at the Grand Jamboree next month!
________________________________________________________________
Syyskuun 26.-28. aikana Aalto-Helsinkiä oli vuoden kolmannessa iGEM joukkueiden tapaamisessa edustamassa Zsofia. Tapaaminen oli Saksan Münsterissä järjestetty JuniorJam.
Tapahtuma oli täynnä mielenkiintoisia työpajoja, arvokkaita harjoitustilaisuuksia ja hauskaa yhdessäoloa ja tutustumista muiden Euroopan tiimien kanssa. Tapaamiseen osallistui yhteensä 14 joukkuetta seitsemästä eri maasta: Saksasta, Alankomaista, Iso-Britanniasta, Itävallasta, Sveitsistäi, Belgiasta ja tietenkin Suomesta.
JuniorJamin suurin tarkoitus oli harjoitella esiintymistä ja kerätä palautetta kolmesta iGEM-projektin pääelementistä, jotka ovat listattu alle. Aiemmista iGEM-osallistujista ja Saksan synteettisen biologian yhdistyksen (GASB) jäsenistä koostuva kolmen hengen tuomariston tehtävä oli arvioida ja antaa palautetta tämän pohjalta.
Varsinainen esittely, kuten lopullisessa Grand Jamboree-konferenssissa tullaan tuomarien edessä tekemään. Tapahtuman toisena päivänä Zsofia antoi 15 minuutin mittaisen esittelyn noin 80 hengen yleisön edessä, käyden läpi ratkaisumme suurimmat motiivit, ongelman jota olemme ratkaisemassa sekä metodit, joita laboratoriossa ja mallintamisessa käytämme. Saimme joitain tärkeitä kommentteja kehityskohteista Pariisissa tehtävää arviointia silmällä pitäen, kuten joidenkin monimutkaisten tieteellisten konseptien yksinkertaistaminen (tarkat mekanismit DARPin kirjastomme valitsemisessa sekä bioreportterimme kokoaminen) ja sujuvamman ja luonnollisemman tarinankerronnan luominen sen sijaan, että jakaisimme esityksemme erillisiin aihealueisiin.
Promovideo, jonka olemme sittemmin viimeistelleet ja palauttaneet 2. Syyskuuta. Videomme vastaanotto oli yleisesti erittäin hyvää, erityisenä vahvuutena sairaalahenkilökunnan haastattelujen sisällyttäminen kroonisiin haavoihin liittyvän ongelman esilletuomiseksi. Tuolloin meiltä vielä puuttui videosta tekstitykset sen kattavuuden lisäämiseksi sekä pari animaatiota biofilmin muodostumisen ja DARPin-molekyylien sitoutumisen visualisoimiseksi.
Juliste ja esiintymiskoju, jotka tulevat olemaan lopullisella tapahtumapaikalla Pariisissa. Saimme joitakin hyödyllisiä kommentteja julisteemme asettelun muuttamisesta DARPin-molekyylien esittelemiseksi jo aikaisemmassa vaiheessa, kuten myös väriteemamme parantelusta erottuvuuden lisäämiseksi. Yleisesti ottaen Zsofia kävi hyviä keskusteluita muiden tiimien kanssa Q Block-projektiimme liittyen, kun useat kilpailijat tulivat kojullemme esittämään tarkempia kysymyksiä DARPin-molekyylien käytöstä ja hyödyntämisestä klinikoilla. Tämä taas antoi uusia ajatuksia siitä, mitä meidän tarvitsee vielä miettiä ennen lopullisen arvioinnin Q&A-tilaisuutta.
Meidän pääyhteistyökumppani, Dresden joukkue, oli myös paikalla tapahtumassa. Valitettavasti heille tarkoitetun DARPinin sekvenssissä olleesta virheestä johtuen Zsofia ei kyennyt toimittamaan kylmäkuivattua GFP:hen kohdennettua DARPinia tapahtumaan, kuten oli alunperin suunniteltu. Olemme kuitenkin korjanneet virheen ja tällä hetkellä ekspressoimme, puhdistamme ja kylmäkuivaamme uutta DARPinia heille. Olemme jo onnistuneesti transformoineet GFP-kohdistusta koodaavan plasmidin α5 E. Coli:iin ja toivomme voivamme noutaa sen pian, jotta voisimme lähettää kylmäkuivatun DARPinin Dresdeniin. Heidän suunnitelmanaan on arvioida meidän DARPinin kykyä läpäistä heidän hydrogeeli.
Tapahtumassa oli kaiken edellä mainitun lisäksi kolme erityisen innostavaa tieteellistä puhetta ja paneelisessiota: Münsterin Max-Planck-instituutin Britta Trappmanin puhe “Angiogeneesin säätely ekstrasellulaarisen matriisin toimesta – biomateriaalien lähestymistapa”, Münsterin yliopiston professori Prüferin esittely kestävän kumin korjuusta venäläisestä voikukasta sekä juristien, bioeetikkojen ja tiedemiesten paneelikeskustelu synteettisen biologian roolista kestävän biotalouden muodostamisessa.
Lisäksi Zsofia osallistui tunnin mittaiseen start-up työpajaan, joka kannusti ajattelemaan projektimme ideaa yrittäjyyden näkökulmasta. Tämä sisälsi niin sanotun "lean canvas" suunnittelun, jolle ideoidaan kohdemarkkinat, valmistusprosessi, kustannuslaskenta ja suunnittelu. Tämä istunto oli erittäin interaktiivinen ja hyödyllinen ajatellessamme ratkaisuamme ideana, jolla on konkreettista potentiaalia haavanhoitomarkkinoille, ei vain kilpailun vuoksi toteutettuna rajallisena tutkimusprojektina. Tien ei tarvitse päättyä iGEM-arvosteluistuntoon!
Lopuksi Münsterin tiimi järjesti kaikille osallistujille upeaa sosiaalista aikaa, kuten ilta Aaseesssa, lounaan syyrialaiselta ruoka-autolta, illan Bar Barzillusissa ja aamiaisen viimeisenä aamuna. Olemme erittäin kiitollisia Münsterille tästä mahdollisuudesta, emmekä malta odottaa, että näemme kaikki muut joukkueet jälleen Grand Jamboreessa ensi kuussa
